mtDNA异质性及其法医学应用

小草范文网  发布于:2020-02-20  分类: 改革开放40周年 手机版
【关键词】mtDNA;
异质性
【中图分类号】D919.2
【文献标识码】B
【文章编号】1007—9297(2006)02—0140—04
线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)是惟一
的细胞核外DNA。人类mtDNA为一裸露的环状双链
结构,长16569 bp,由富含嘌呤的重链(H链)和富含
嘧啶的轻链(L链)组成。mtDNA编码区的序列相对保
守,其非编码区长1 122 bp,又称为控制区。控制区的
碱基变异相对集中分布在15996~16401nt和29~408
nt两个区段,分别称为HV I和HVlI。后来,Lutz等【l】
发现在438~574nt间也存在较多的碱基变异,称为
HVⅢ。mtDNA呈母系遗传特征,加之其拷贝数多、突
变率高、抗腐败能力强,具有极高的法医学应用价值。
个体发育源于一个受精卵,理论上同一个体所有
的mtDNA序列应是一致的。但实际却发现有少数同
一个体的mtDNA碱基序列并不完全相同。这种同一
个体mtDNA出现两种或两种以上的碱基序列的现象
称为异质性(heteroplasmy)。121其在人体的存在表现为
同一个体不同组织、同一组织不同细胞或同一细胞不
同线粒体之间存在不同的mtDNA序列。

、mtDNA异质性形成的可能机理
mtDNA异质性发生机制至今还不是很清楚
Hauswi~h和Laipis(1982)在研究牛线粒体DNA多态
性时发现异质性线粒体DNA在卵母细胞和胚胎早期
发育阶段发生快速分离的现象,从而提出线粒体DNA
遗传的瓶颈理论。[31后来人们多用该理论来解释
mtDNA异质性的形成原理。
mtDNA异质性的本质是突变.即突变型和野生型
mtDNA以不同比例共存,其发生与mtDNA拷贝数多、
不对称复制及缺乏校正修复机制等密切相关。瓶颈理
论认为:卵母细胞在分化成卵细胞及形成受精卵的过
程中,卵母细胞和受精卵中数千个mtDNA子集合群
体(不同序列mtDNA混合),似通过瓶颈一样的阻塞
作用而使各个mtDNA子集合群体数量明显减少,只
有少数mtDNA进行选择性复制,故一种突变基因型
可以占优势并固定出现在下一代中。Ashley等[41发现
该“瓶颈理论”结果与人类mtDNA相似,即在单个个
体中异质性的大小可以改变,子代可以有不同的基因
型,仅仅两三代异质性就可以转为同质性。
共存的突变型和野生型mtDNA通过减数分裂或
有丝分裂随机分布到子代细胞中,由此细胞中突变型
和野生型mtDNA比例随之发生随机增减,也称遗传
渐变,最终,再分裂的子代细胞有向全部为突变型或
野生型mtDNA。即同质体的方向发展的趋势,该过程
称为“复制分离”。随着复制分离和遗传渐变的发生,
一些mtDNA中选择作用不明显的突变建立起同质
体.并以一定的频率保留于人群中.形成mtDNA某些
区段的多态性。然而,一些重度突变因复制分离造成
的同质体个体极易因自然选择而淘汰。因而,多数重
度突变无法建立起同质体,表现为异质体,异质体在
人群中往往只能建立较低频度的多态性。
遗传瓶颈出现在卵细胞形成过程中的推测后来
得到了证实。Bendall等【5I研究了180对双胞胎,其中
发现4例有异质性。采用遗传渐变理论模式推算,估
计减数分裂的代间瓶颈大约有2至,100个分子.对于
特定的母子间传递的mtDNA估计有3~2O个分子
作者计算人mtDNA—HVI的突变和固定的率在1.2x
1O ~2.7×10-5/每代、每位点之间,相当于1个转位
突变/2500年至1转位突变/55000年的范围。调查结
果与其他文献报告基本相符,说明遗传瓶颈相对比较
狭窄,形成了一种制约因素。调查结果也证实,不同的
母系间的瓶颈大小确有差异。
一个成年人体内mtDNA估计有一兆,mtDNA复
制聚合酶缺乏忠实性,受精后的细胞发育过程中出现
变异,形成组织间mtDNA型别差异的可能性的确存
在。有研究发现原胚层组织异质性是一致的,胎儿各
组织型别一致,但到了成人,不同组织的异质性分布
【作者简介】翟仙敦(1977一),女,山西临汾人,硕士研究生,助教,主要从事法医遗传学研究。Tel:+86—027—83692645;
E—mail:san—
mao506@ 163.corn 。
法律与医学杂志2006年第l3卷(第2期)
出现差异。Tully等(1998)用DGGE方法检测21名成
年人不同组织如血、骨、毛发、肝、肌肉,发现异质性出
现的程度有差异,有的容易检出 有的不能检测。研究
资料显示,在细胞分化、发育过程中,也可有mtDNA
控制区碱基变异。实验观察组织问异质性的发生存在
与卵细胞形成过程中类似的瓶颈,Ciafaloni等发现同
一个体不同组织变异型与野生型mtDNA出现率有差
异,证实了组织问存在异质性的分离。例如某妇女,经
过多次提取口腔拭子和血样,检测出异质性,同个体
头发材料,5根是16355T,3根是16355C,2根是两种
型的混合物。提示在细胞分化、发育过程中也可能存
在另一种瓶颈。
二、mtDNA异质性的类型及好发位置
异质性按其存在形式分为点异质性和长度异质
性两类,它既可发生在代问也可发生于代内。正常人
mtDNA异质性高发于控制区,而编码区几乎没有。[61
通常,异质性序列之间差异仅限于某一个碱基,称
为点异质性。同时出现两个位置碱基序列不同的概率
虽小,但仍有报道:而同时出现3个或者3个以上的
情况至今尚未见报道。mtDNA序列变异主要是复制过
程中碱基错配,其中转换占90%以上。少数是颠换。点
异质性主要集中于HVI和HVII。HVI碱基转换类型
多发生在嘧啶之间,约为80%。HVII的转换碱基中,
嘧啶与嘌呤约各占一半。颠换多发生于C和A之间.
并几乎都集中在HVI。人群中点异质性的发生率因检
测方法的灵敏度不同而差异很大。HVI 16 189nt碱基
替换的发生率很高,其中T—C转换高达l5%。
长度异质性主要发生于HVI 16184 16193 nt
和HVII 303—315 nt的C—stretch区,表现为C数目
的差异。在序列测定时可观察到16 189 nt和310 nt
后多个信号峰交叠形成的模糊序列,即“手指样结
构”。[71根据Anderson序列,C—stretch分别于16 189 nt
和310nt被T阻断,可能由于复制滑动引起的相同碱
基单调连续趋势,该区被认为是突变的热点 而这一
趋势产生了长度异质性。Bendall等[8】也认为长度异质
性形成原因主要是DNA 复制滑动。无关个体问
mtDNA长度异质性差异较大,根据HVII 303 309
nt碱基C数目的多少,可分为单纯同质性(C7)、轻度
异质性(C8为主)、明显异质性(C8和C9为主)和T—C
转换后序列失控(C10一C14)4种。HVI 16 189nt约
l5%的T—C转换中又有66%形成长度异质性。[91与
HVI不同,HVII的T很少缺失。由此认为HVII的长度
异质性机制是C在303—309 nt区域内的插入和复制
滑动,形成3lOnt p C的转换。同一母系中,与16 189
· l4l ·
突变相关的长度异质性,分布和变化相对稳定,但无
关个体问差异很大。Bini等[1Ol研究发现异质性长度C
的个数与C—stretch上游的A碱基数目呈负相关,相
对于C数目的不稳定性,同一个体A数目恒定,这一
发现对家系分析和法医学领域中包括单根毛发在内
的组织比较有较大意义。一般而言,如果C—stetch区
的C多于8个,就会增加长度异质性的几率。⋯1
通常.骨骼肌和神经组织的异质性水平相似,毛
发中相对较高.外周血的异质性最低。[121
三、mtDNA异质性检测方法
(一)测序
序列测定是检测mtDNA多态性和异质性最常用
的方法。尽管一直以来测序被认为是检测突变的金标
准,但若异质性水平低于20%该方法即很难检出,这
也是先前普遍认为异质性发生率很低的原因。克隆后
测序又比PCR产物直接测序更可靠,因其可排除因
PCR过程中Taq DNA聚合酶滑脱造成的序列改变。
对HVII轻链测序发现,由于临近C—stretch区产生的
长度异质性使3lOnt的异质性比率达50%,这是一种
普通的人为假象,通过对重链的测序可消除该假象。[131
因此为避免可能存在的影响,mtDNA高变区序列测定
要求对重链和轻链进行双向测序,并至少重复一次。
(二)序列特异性寡核苷酸(ASO)探针杂交
PCR—ASO分析技术先用PCR扩增得到靶DNA
片段,再用ASO探针与目的DNA扩增片段杂交.阳性
结果说明靶DNA含有与探针相应的等位基因。尽管
PCR—ASO分析技术有操作简单、灵敏度高、特异性好
等优点,但目前所用特异性探针较少,系统的个人识
别能力有限是其局限性之一。多重PCR特异性寡核苷
酸片段用于检测突变链,可以发现小于l%的异质性,
然而等位特异性扩增很容易受PCR初始熔链温度的
影响,易发生错误的扩增,且无法估计异质性的数量。
(三)限制性片段长度多态性(restriction 哪ent
length polymorphism,RFLP)分析
在mtDNA高变区,大约有2/3的碱基变异涉及限
制酶识别位点,故可用RFLP检测点异质性。与直接测
序相比,荧光RFLP分析较低程度的异质性更灵敏一
些。但应注意避免因不完全消化而导致错误的结论。
(四)单链构象多态性(single strand conformation
polymorphism,SSCP)分析
PCR—SSCP技术可灵敏地检测到单一碱基的突
变,且具有操作简单、快速、成本低、灵敏度高、无假阳
性等特点,适用于大样本DNA突变的筛查。但存在影
响因素较多、条件不易掌握及带型难以解释等问题。
· 142 ·
基于毛细管电泳技术发展起来的荧光SSCP(F—SSCP)
技术,其灵敏度非常高,特异性好,但技术要求及成本
均很高。
(五)变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gel
electrophoresis,DGGE)
DGGE是基于待测DNA片段双螺旋的解链温度
(Tm)来进行突变检测的,它具有灵敏度高、分离片段
可回收测序、一次可检测大量样本等优势。1999年,
Steighner等㈣在评估PCR—DGGE技术检测mtDNA
HV1序列多态性的可靠性时。所有设计的49对配对
序列(每对仅存在1bp差异)用该技术可全部有效加
以区分。PCR—DGGE技术检测异质性的灵敏度高达
l% ,远远高于序列测定。但该技术存在实验之初需进
行计算机分析或预试验以确定最佳的分离条件、需使
用带GC—clamp的引物增加了实验费用、GC含量较高
的片段不易分析、制备精确的梯度凝胶需要熟练的操
作技巧及复杂的仪器设备、仅能检测突变的存在不能
确定突变的类型等不足
(六)变性高效液相色谱(denaturing high—performance
liquid chromatography,DHpLC)技术
DHPLC是一种可自动检测单碱基替代及小片段
核苷酸插入或缺失的一种高性价比分离技术.具有自
动化、快速、经济、检出率高、检出DNA片段大小范围
广、既可分析已知突变也能筛查未知变异等优点.成
为目前分析已知或未知基因突变及单核苷酸多态性
的最佳技术平台。目前只有F—SSCP技术在敏感性和
特异性方面能与DHPLC相媲美。其不足是不能检测
纯合突变(要检测纯合变异一定要预混等量的野生型
样品以产生异源杂合双链),只能提示突变的存在.无
法确定具体的错配类型及位置,尚需测序进一步确
定;
许多片段有多个主要解链温度.需要筛查的温度
点较多,增加了工作量。
DHPLC可直接通过异源双链的形成来检测异质
性的存在。如有必要,还可根据保留时间的差异将不
同的片段各自收集后测序
(七)其他检测方法
融解曲线分析、基质辅助激光吸附电离飞行时间
质谱(Matrix Assisted Laser Desorption Lonization Time
of Flight Mass Spectrometry,MALDY—TOF—MS).DNA
芯片(DNA chip)等技术,都可以用于mtDNA异质性
的检测
四、mtDNA异质性的法医学应用及展望
mtDNA因其母系遗传特征、进化速率快、拷贝数
多等特点,使其在法医学鉴定中,尤其是对毛干、指甲
法律与医学杂志2006年第13卷(第2期)
等无核生物检材或核DNA分型失败的样本具有特殊
的应用价值。一方面,由于mtDNA异质性的存在,使
其在进行常规个体识别和亲子鉴定等应用时使鉴定
结果产生不确定性;
另一方面,mtDNA异质性又可作
为个体的特殊标记,增加个体的认定或排除的确定
性。
法医个体识别鉴定中第一次遇到异质性问题是
末代沙皇尼古拉二世的遗骸鉴定案。l15】此后,mtDNA
异质性问题逐渐引起法医学界的重视。早期研究认
为.mtDNA的异质性在正常人群中很少见,可能与当
时的检测技术缺乏敏感性有关。随着相关技术的发
展.越来越多的文献报道在非编码区检出异质性,并
且以一定的频率存在于正常人群中。2O0o年,Tully等
用DGGE技术对253个随机个体血样的mtDNA
HV1进行了分析.发现35个个体(13.8%)存在异质
性.其中33个为单核苷酸异质.2个为二核苷酸异质,
这些异质性共涉及16个不同的核苷酸.进一步证实
了mtDNA异质性存在的普遍性。Salas等 (20o1)报
告1例强奸案的头发.在同一根被害人头发的2个不
同部位取材.竟然发现序列有差异.一个结果是16 093
T.16 189T:另一个结果是16093C/T.16 189C/T 由于
序列测定检测mtDNA异质性灵敏度较低. 因而
mtDNA异质性的出现对测序这种在法医学实践中应
用最广泛的mtDNA鉴定手段是一种挑战
当比对两份mtDNA的序列时.若DNA序列相同
则表明这两份检材有可能来自同一个人或同一个母
系亲属,尤其是它们之间还具有相同的异质性时.这
种概率更大。国际法医遗传学会规定.在遇到两个样
本出现一个碱基不同,而且这个碱基位置被公认为是
异质性热点,则不能排除:当遇到两个碱基位置不同
时,如果两个位置都是异质性热点,则不能排除.否则
为不能判断。当出现3个位置的不同时.目前还没有
群体数据显示同一个体异质性同时在3个位置出现
情况,在排除污染、细胞核假基因扩增产物的情况
下,并按照国际法医遗传学会mtDNA标准操作方法
执行的,可以做出排除结论。为避免错排.尤其是比较
来自毛发mtDNA样品时,建议尽可能多的分析样品.
需要再取其他的材料如多根头发、唾液或血样进行复
查,以减少因异质性存在而被错排的可能性.如果多
份检材的异质性出现在同一位置的同一碱基处.反而
对认定同一个体检材有利
mtDNA的异质性发生机制及在人群中、个体内不
同组织中的发生频率究竟有多高. 目前还未明了.有
待于进一步研究。由于异质性的存在.对于个体识别
法律与医学杂志2006年第l3卷(第2期)
的鉴定,必须正确评估mtDNA在法医常规检案工作
的重要性。因此,要对样本做出相应准确可靠的判断,
首先要了解群体中异质性的分布情况.熟悉各种异质
性出现的概率和相应位置。这就要求对群体进行异质
性调查,建立相应的异质性数据库,从而为线粒体
DNA在法医学上的应用提供有效保证。异质性的检出
在很大程度上依赖检测方法的灵敏度.但目前尚未有
标准化的方法来检测mtDNA异质性.需要开发一种
标准化的检测方法作为金标准。
参考文献
[1] Lutz s,Weisser HJ,Heizmann J,et a1.A third hypervariable region
in the human mitochondrial D-loop【J].Hum Genet,1997,101:384
[2] Lutz S,Weisser HJ,Heizmann J,et a1.Mitochondrial heteroplasmy
among maternally related individuals[J].Int J Legal Med,1999,1 13:
155~161
[3] Hauswirth WW, Laipis PJ.Mitochondrial DNA polymorphism in a
maternal lineage of Holstein COWS 【J]. Proc Natl Acad Sci U S A,
1982,79(15):4686-4690
f4] Ashley MV,Laipis PJ,Hauswirth WW.Rapid segregation of hetero—
plasmic bovine mitochondria【J].Nucleic Acids Res,1989,17:7325~
7330
[5] Bendall KE,Macaulay VA,Baker JR,et a1.Heteroplasmic point mu—
tations in the human mtDNA control region [J]. Am J Hum Genet,
1996,59(6):1276~1287
【6] Gill P,Ivanov PL,Klimton C,et a1.Identification of the remains of
the romanov family by DNA analysis[J].Nature Genet,1994,6(2):
130~135
【7] Htihne J,Pfeiffer H,Brinkmann B.Heteroplasmic substitutions in the
mitochondrial DNA control region in mother and child samples [J1.
Int J Le gal Med,1998,112:27~30
【8] Bendall KE,Sykes BC.Length heteroplasmy in the first hypervariable
· 143 ·
segment of the human mtDNA control region,Am J Hum Genet,1995;

57:248~256
[9] Bini C,Ceccardi S,Luiselli D,et a1.Different informativeness of the
three hypervariable mitochondrial DNA regions in the population of
Bologna(Italy)fJ].Forensic Sci Int,2003,1 35:48-52
【lO] Malik S,Sudoyo H,Pramoonjago P,e1.a1.Nuclear mitochondrial in—
terplay in the modulation of the homopolymeric tract length hetero—
plasmy in the control(D-loop)region of the mitochondrial DNA 【J].
Ham Genet,2002,1 10:402-4 1 1
[1 1] Lee HY,Chung U,Yoo JE,et a1.Quantitative and qualitative profil—
ing of mitochondrial DNA length heteroplasmy【J].Electrophoresis,
2004,25:28~34
[12] Takayanagi K,Asamura H,Tsukada K,et a1.Investigation of mtDNA
heteroplasmy discordance between mother and child[J1.Int Congress
Series.2004.1261:380-382
[13] Lutz-Bonengel S,Sanger T,Pollak S et a1.Diferent methods to de—
term ine length heteroplasmy within the mitochondrial control region
[J].Int J Legal Med,2004,118:274-281
[14] Takahashi N,Hiyam a K,Kodaim M,et a1.The length polymorphism
in the 5 flanking region of the human beta—globin gene with de—
naturing gradient gel electrophoresis in a Japanese population [J1.
Hum Genet,1991,87(2):219~220
[15] 郭景元,李伯龄. 中国刑事科学技术大全法医物证学[M].第1版.
北京:中国人民公安大学出版社.2002. 490
[16] Tully LA,Parsons TJ,Steighner Pd,et a1.A sensitive denaturing
gradient-Gel electrophoresis assay reveals a high frequency of het—
eroplasmy in hypervariable region 1 of the human mtDNA control re一
西0n[J].Am J Hum Genet,2000,67(2):432-443
【17】Salas A,Lareu MV,Carracedo A.Heterplasmy in mtDNA and the
weight of evidence in forensic mtDNA analysis:a case report fJ].Int
J Legal Med,2001,114:186-190
(收稿:2005—1 1—22;
修回:2006—03—02)
、! |、
(上接第S4页)
良后果承担完全责任。建议我国借鉴美国的相关规定
来立法。
4.智能障碍(痴呆)和遗忘综合征:这类吸毒者的
脑病理改变程度相当严重,恢复正常的可能性不大,
即使评定有刑事责任能力,也无受审能力和服刑能
力,为节省办案成本和发扬人道主义精神,建议对他
们评定为部分或者无刑事责任能力。
5.残留性或迟发性精神障碍
其中的痴呆和遗忘综合征按“智能障碍(痴呆)和
遗忘综合征”处理,其他的均评定为有刑事责任能力。
为缩减控制吸毒人数,有法学人士主张我国刑法
应规定吸毒为犯罪行为。事实上,吸毒人群的确是犯
罪的高危人群,吸毒者成瘾后一般都有人格改变,变
得缺乏责任心、喜欢说谎、自制力差和懒散等,加上作
为下临床诊断的主要症状之一,也就是意识障碍,它
不同于别的精神症状.即医生鉴定时往往不能当场直
接发现该症状,确定有无意识障碍主要依靠警方收集
的材料和被鉴定人案发后的积极配合,能指望爱说谎
的吸毒者积极配合查证吗?有鉴于此,鉴定医生诊断其
精神障碍的准确性和法庭对部分刑事责任能力结论的
采信度不无疑问。所以,笔者仍继续主张对精神异常的
吸毒者犯罪一般以完全刑事责任能力评定为最优。如
果吸毒诱发了自身原有的精神病,且本人对作案行为
丧失或减弱辨认或者控制能力,则评定为部分刑事责
任能力。不评定无刑事责任能力是因为吸毒本身为法
律所禁止,行为人未尽戒毒义务有一定的主观过错,对
这部分过错本人应该承担相应的法律责任。

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