山东省科学院成立于1979年，是省政府直属的事业单位，是山东省最大的综合性自然科学研究机构，前身为始建于1958年的中国科学院山东分院。经过三十多年的发展，山东省科学院初步建成创新体系完整、特色鲜明、能力较强、发展持续的现代科研院所,成为全省最大的公共综合科技创新平台，在全省科技创新体系中发挥了重要的支撑和前沿骨干作用，综合实力居于全国地方科研院所前列。
全院下设海洋仪器仪表研究所、激光研究所、山东省计算中心、山东省分析测试中心、自动化研究所、能源研究所、新材料研究所、生物研究所、生态研究所（生物中心）、山东省科技发展战略研究所、情报研究所、高新技术产业（中试）基地、菏泽分院、山东省机械设计研究院、山东省食品发酵工业研究设计院15家创新研究机构，分布在济南、青岛、济宁、菏泽四个城市，与临沂市政府合作设立临沂分院。全院占地面积1450亩，建筑面积30万平方米。资产总额20余亿元，大型科研仪器设备近千台套。
山东省科学院在大多数省份录取批次属于本科二批，所以被普遍认为是二本，但是教育部门没有明确该校属于几本。